Description de l'entreprise
Business & Decision a rejoint le groupe Orange et est une Direction d'Orange Business Services SA.
Depuis sa création, Business & Decision est spécialisé dans le recueil, l'analyse, l'exploitation et la valorisation des données.
Ses équipes, réparties dans plusieurs pays et dans 14 villes en France, conçoivent et déploient les solutions et les services les plus innovants pour accompagner les directions métier à relever les défis majeurs de transformation de leurs organisations par l'adoption des technologies de pointe. Data Intelligence, Big Data et Data Gouvernance, véritables socles de l'intelligence artificielle et de l'expérience digitale, sont les domaines de spécialisation des équipes d'experts engagées dans les projets d'envergure des clients et dans les pratiques éthiques et responsables.
Actuellement nous sommes à la recherche d'un Bio-informaticien
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Description de la fonction
Tâches et livrables
L'estimation de l'effort pour chaque tâche et l'ordre de priorité des tâches doivent être les suivants.
Livrable 1 (5 mois)
Soutenir l'analyse des données des expériences de dépistage des sérums en collaboration avec l'équipe de science des données de découverte.
Tâches
- Génération d'un pipeline analytique pour le criblage de sérums
- Analyse des données de criblage des sérums et intégration des données
- Soutien bio-informatique pendant les efforts de découverte d'antigènes (p. ex., établir un lien entre la structure et les problèmes de solubilité, le cas échéant, afin d'orienter la stratégie de laboratoire ; prédire la structure et fournir des renseignements supplémentaires sur les candidats prometteurs) ;
- Participer aux réunions hebdomadaires du laboratoire
Livrable 2 : (4 mois)
Génération d'un pipeline analytique pour l'intégration de données de lectures d'anticorps monoclonaux recombinants (par exemple, productivité, affinité, liaison d'épitopes)
Tâches
- Développez et mettez en œuvre des algorithmes pour intégrer divers types de données, tels que des mesures de productivité, des mesures d'affinité et des profils de liaison d'épitopes.
- Envisager des méthodes statistiques et informatiques pour harmoniser les données
- Créer des scripts ou des flux de travail qui fusionnent les informations de manière cohérente, permettant une vue holistique des caractéristiques des anticorps monoclonaux.
- Participer aux réunions hebdomadaires du laboratoire
Livrable 3 : (12 mois)
Soutenir l'analyse des données d'expériences multi-omiques sur cellule unique en collaboration avec l'équipe de science des données de découverte.
Tâches
- Développer des méthodes d'intégration de données provenant de différentes modalités omiques, telles que le séquençage de l'ARN unicellulaire (scRNA-seq), le séquençage BCR/TCR et la transcriptomique spatiale.
- Explorez et mettez en œuvre des algorithmes ou des outils de calcul qui permettent l'intégration de divers ensembles de données, permettant une analyse complète de l'hétérogénéité et des interactions cellulaires.
- Étudier les corrélations fonctionnelles entre la diversité clonale et les modèles d'expression génique.
- Développer des scripts personnalisés ou utiliser des outils existants pour l'identification des clonotypes, les mesures de diversité et l'intégration avec les données d'expression génique.
Profil
- Doctorat en bioinformatique, en biologie computationnelle, en biostatistique ou dans un domaine connexe. Le master peut être envisagé sur la base de l'expérience antérieure.
- Solide expérience en biologie computationnelle et en méthodologies bioinformatiques, avec un accent sur l'analyse de données multi-omiques
- Maîtrise des langages de programmation couramment utilisés en bioinformatique, tels que Python et R.
- Connaissance de l'analyse et de l'intégration de données multi-omiques, y compris la transcriptomique unicellulaire, le séquençage BCR/TCR
- Connaissance des méthodes statistiques pour l'analyse de données de grande dimension
- Une connaissance supplémentaire de la biologie structurale et des plateformes logicielles comme MOE, ou tout logiciel équivalent (Rosetta / Schrödinger) est un plus.
- Orienté résultat, rigoureux et structuré.
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